从西方发达国家的金融实践活动中可以看到,企业往往可以通过并购的方式完成自身快速发展的目标,从企业的战略实施的角度来看,并购行为也是企业重要的经营战略举措。
3.1单细胞基因测序技术有助研究癌症起因和治疗首先谈一下癌症的异质性:中晚期的肿瘤或由一系列的肿瘤克隆组成,每一种克隆有着独立的变异,形态和药物反应。Illumina也通过和Clontech合作,推出了单细胞RNA测序服务。
Gawad et al., (2015)更是指出,三种全基因组扩增技术并没有明显的胜者,具体方法的使用取决于研究的目的。图7:肿瘤的异质性资料来源:Illumina,民生证券研究院实体瘤由一系列不同的细胞组成,包括癌症纤维细胞,内皮细胞,淋巴细胞,巨噬细胞等。2)激光捕获显微切割技术Laser Capture Microdissection(LCM)LCM技术可以在显微镜直视下快速、准确获取所需的单一细胞亚群,甚至单个细胞,从而成功解决了组织中细胞异质性问题。图8:卵母细胞减数分裂产生极体的过程资料来源:Genome Analyses of Single Human Oocytes,民生证券研究院(注:其中PB1和PB2是第一极体和第二极体)3.3 单细胞基因测序打开免疫报多样性研究之门用单细胞基因测序分析免疫细胞的原因是现存的多样的病原体导致了免疫细胞的高度异质性,传统的检测方法,取样来自一大堆细胞,低估了单个免疫细胞的多样性,所以我们需要更加精确检测单个免疫细胞的遗传物质,从而理解机体复杂的免疫机制。其基本原理是通过一低能红外激光脉冲激活热塑模-乙烯乙酸乙烯酯(EVA)膜,在直视下选择性地将目标细胞或组织碎片粘到该膜上。
主要 利用3′端ATGTGG这6个在人体中分布频率极高的碱基作为引导, 以6个碱基的随机序列来决定特异的扩增起始位点,从而达到扩增整个基因组的目的。AbVitro公司的技术起源于哈佛大学George Church的实验室,AbVitro的技术包括对单个T细胞和B细胞进行基因测序,帮助科学家们理解T细胞受体(T cell receptor α和β链的基因的复杂性。平台开发人员由引进于VMware、微软的资深云计算工程师与已处理过上万个项目、发表数百篇SCI核心期刊文章的生物信息分析团队组成,采用敏捷软件开发模式,实现了系统的快速升级与功能的快速优化,从测试版本上线到近日的百迈云3.0上线,平台已经完成了数十次的整体升级与数百项的功能优化。
目前百迈客云已经积累的数以千计的注册用户,已经为国内基因组学研究人员成功解决了数百项的数据分析难题。云计算的独到之处就在于几乎可以提供无限廉价的存储与计算能力。作为专门为国内基因组学研究者打造的生物信息分析云平台,针对国内生物信息分析人员相对稀缺、对第三方数据分析服务提供商依赖性较大的特点,百迈客云提供了相较于国内外同类型云计算平台更高集成化程度的基因组学数据挖掘平台,无需用户自己整合各类分析软件搭建分析流程,真正意义上实现一键完成数据分析,另外分析平台还提供了独创性的个性化分析数据挖掘功能,分析内容更加全面,无需依赖第三方,得到更加符合预期研究目的的数据分析结果,目前分析平台覆盖了转录调控、微生物多样性、动植物重测序、人类疾病等多个组学研究领域。另外,数据安全作为数据分析过程中重中之重,百迈客云平台采用底层数据加密存储,提供了严格的用户资源隔离,并利用完善的角色权限控制对用户数据进行多级数据权限控制,网站的数据传输采用SSL加密传输协议,从多个层面确保用户敏感的基因数据的安全。
另外,百迈客云也为用户提供了更加快速、准确的公共数据检索与分析功能,让你的分析更加有章可循,有据可参作为国内将云计算与生物信息融合的先驱者,百迈客云采用独创的云计算文件系统BMKFS,该文件系统由百迈客研发人员针对生物信息分析的特点开发,支持本地的块存储和基于云的对象存储(例如AWS的S3和阿里云的OSS)。
百迈客云借助这一技术轻松满足了大数据背景下基因组学研究人员对于基础计算资源的巨大需求。百迈客云的出现是对生命科学研究模式的变革。百迈客云整合新型的云计算技术与6年的生物信息分析经验为国内的基因组学研究者提供了合理高效的解决新型方案。目前百迈客云已经积累的数以千计的注册用户,已经为国内基因组学研究人员成功解决了数百项的数据分析难题。
作为专门为国内基因组学研究者打造的生物信息分析云平台,针对国内生物信息分析人员相对稀缺、对第三方数据分析服务提供商依赖性较大的特点,百迈客云提供了相较于国内外同类型云计算平台更高集成化程度的基因组学数据挖掘平台,无需用户自己整合各类分析软件搭建分析流程,真正意义上实现一键完成数据分析,另外分析平台还提供了独创性的个性化分析数据挖掘功能,分析内容更加全面,无需依赖第三方,得到更加符合预期研究目的的数据分析结果,目前分析平台覆盖了转录调控、微生物多样性、动植物重测序、人类疾病等多个组学研究领域。百迈客云3.0的上线旨在为用户提供最全面的分析内容、最友好的用户界面、最流畅的分析体验、最简单智能的分析操作,期待您的体验与使用。云计算的独到之处就在于几乎可以提供无限廉价的存储与计算能力。百迈客云:探索生命科学研究变革新模式 2016-03-01 09:51 · wenmingw 百迈客云整合新型的云计算技术与6年的生物信息分析经验为国内的基因组学研究者提供了合理高效的解决新型方案。
百迈客云以基因数据的在线分析出发,让更多的用户通过百迈克云平台将数据分析变的简单、经济,为生命科学研究提供强有力的支持。面对基因数据的指数积累,传统解决方案是添置更多的本地服务器,招募更多的生物信息分析人员,而服务器配置维护、人员招募成本高昂,且可操作性低。
依赖于第三方数据分析服务存在分析周期长、沟通成本高、标准化的分析无法满足科研需求等缺点,这些已经严重制约了基因组学的顺利开展。基因组学研究为21世纪生命科学研究领域中非常重要关键的一部分,而随着近年来高通量测序技术的快速发展,基因数据呈现出指数增长,以高通量测序数据库SRA(NCBI维护)为例,2009年数据收录量为10TB,2011年接近100TB,2014年突破了1PB,2015年接近5PB,2016年有望突破10PB。
使得用户可以像使用本地硬盘一样使用存储,同时还提供了无限量存储空间的扩展能力,大大提高数据可用性。平台开发人员由引进于VMware、微软的资深云计算工程师与已处理过上万个项目、发表数百篇SCI核心期刊文章的生物信息分析团队组成,采用敏捷软件开发模式,实现了系统的快速升级与功能的快速优化,从测试版本上线到近日的百迈云3.0上线,平台已经完成了数十次的整体升级与数百项的功能优化。百迈客云是一个集大数据挖掘、共享、管理和科研协作的整合平台,优质的基础资源通过网络随时获取,可视化的操作界面适合无任何编程基础以及生物信息分析经验的研究者,我们要做的就是让你只需专注于科研,无需考虑IT。另外,数据安全作为数据分析过程中重中之重,百迈客云平台采用底层数据加密存储,提供了严格的用户资源隔离,并利用完善的角色权限控制对用户数据进行多级数据权限控制,网站的数据传输采用SSL加密传输协议,从多个层面确保用户敏感的基因数据的安全。此外,文件系统还提供了多用户资源隔离的机制,具备多种鉴权和授权机制,确保用户的数据安全。2015年10月百迈客商业版百迈客云1.0云正式上线运营,成为了国内第一个适用于多个组学研究领域的综合性的商业化运营生物云计算平台。
借助云计算技术,基因组学研究者可以通过网络方便的获取大量基因数据分析所需要的基础计算资源(存储、计算等),无需购置昂贵的本地服务器。其中部分生物学实验室会选择依赖于第三方测序数据分析服务提供商。
未来百迈客希望用户在使用云平台时既可以实现对数据的分析、共享,具有相同领域的用户可以进行交流协作,也可以针对具体数据的处理进行分析工具的开发,实现整个研究体系的互动和和谐发展。另外,百迈客云也为用户提供了更加快速、准确的公共数据检索与分析功能,让你的分析更加有章可循,有据可参。
依赖于本地服务器与专业生信分析人员的传统数据分析模式已经难以满足这一大数据背景下的基因组学研究。百迈客云于2014年5月开始上线测试,2015年9月召开产品论证会,到会专家有华中农业大学信息学院院长张红雨教授,中国科学院北京基因组研究所章张研究员,阿里云批量计算服务、高性能计算产品经理、高级专家丛兰兰女士,微软资深合作伙伴、技术顾问、云计算家杨永波先生,论证会上专家们就云平台的前期开发给予了充分的肯定,一致认为,百迈客生物云平台达到国际先进水平。
该文件系统与现有的S3FS,S3QL相比,读写性能都有了极大提升即使有了产前基因检测技术的发展,但孕妇也只能被动接受上天的运气,需要经历多次重复怀孕-产前基因检测-引产或生育的过程,直到得到一个正常的孩子,给孕妇的心理和健康都带来很大的压力和伤害。PGD技术的发展和进步,对遗传性肿瘤疾病干预有了更强大的措施,从源头上阻断和消除肿瘤易感基因对下一代的困扰已成为可能。2月28日,从上海交通大学附属国际和平妇幼保健院(以下简称国妇婴)获悉,国内首例采用单细胞高通量测序技术的第三代试管婴儿甜甜(化名)顺利诞生。
据介绍,甜甜的父亲患有甲状腺癌,此前接受过基因检测,将有50%的机会将致病基因遗传给下一代,通过这项最新的基因筛查以及测序技术,医学专家阻断了婴儿家族性甲状腺癌遗传的可能。两个月后,经过与家属充分谈话及沟通,选择了质量最好的第1号胚胎植入吴女士子宫,并顺利妊娠。
在孕中期经羊水穿刺和产前基因诊断显示胎儿正常。2015年,国妇婴成为上海唯一一家获得国家卫计委批准的高通量基因测序植入前胚胎遗传学诊断临床应用试点单位。
经会诊,黄荷凤团队认为可以通过单细胞高通量测序联合核型定位PGD技术阻断该家族性甲状腺髓样癌。而高通量基因测序技术可以通过对基因测序分析,更精准地识别致病基因。
高通量基因测序的PGD策略对致病基因的识别更为精准。由于李先生妻子吴女士(化名)同时合并输卵管因素不孕症,他们决定通过辅助生殖技术要一个不遗传这种家族肿瘤易患疾病的健康孩子,为此,特地到国妇婴找到了在PGD方面有多年研究积累和临床经验的黄荷凤教授团队。6个胚胎中挑选最佳的妊娠 2015年,李先生和吴女士在国妇婴完成了致病基因验证与筛查,国妇婴生殖遗传科对该家系采用了单细胞高通量测序和核型定位两个技术平台的双重检验策略,在确认每一个环节都百分百精确后,于2015年2月取卵,经过了胚胎的培养和筛查,从6个胚胎中选出了4个完全正常的胚胎。据悉,2015年,国妇婴成为上海唯一一家获得国家卫计委批准的高通量基因测序植入前胚胎遗传学诊断临床应用试点单位。
何为PGD技术?据悉,PGD技术即植入前胚胎遗传学诊断,俗称第三代试管婴儿技术,通常指胚胎在植入母亲体内之前先进行遗传检测,筛选遗传学正常的胚胎植入母亲子宫,从而防止因为胚胎自身染色体或基因变异造成的流产或遗传病患儿的妊娠和出生。基因筛检阻断致病基因 患癌男生出健康试管婴儿 2016-03-02 06:00 · brenda 2月28日,从上海交通大学附属国际和平妇幼保健院(以下简称国妇婴)获悉,国内首例采用单细胞高通量测序技术的第三代试管婴儿甜甜(化名)顺利诞生。
2月28日,吴女士顺利诞下一名女婴,体重3060克,身长50厘米,评分各项指标均为10分。这是国内第一位运用单细胞高通量测序联合核型定位技术对遗传性甲状腺癌致病基因RET进行筛检而生出的健康婴儿。
专家表示,此前受限于医学科技的发展,不少人碰到李先生这种情况,因为害怕把患病基因遗传给未来的孩子,往往会失去生育甚至组建家庭的愿望。目前医院已开展智力障碍、脊髓性肌萎缩症、常染色体隐性多囊肾病等17种单基因疾病的产前基因诊断,其中4个遗传病家系的异常妊娠得到终止。